La línea de investigación Ciencia y Cultura en la Historia tiene como objetivo principal desarrollar investigaciones en Historia de la Ciencia, tanto a nivel de Maestría como de Doctorado. Parte de la comprensión de que la ciencia es un producto de la cultura.
La línea de investigación Historia y Culturas Políticas considera el estudio de las interpretaciones y el pensamiento político de la modernidad. Está dirigida al examen del fenómeno de lo político, desde sus varias perspectivas.
La línea de investigación Historia Social de la Cultura alberga estudios orientados a la cultura, entendida como universo común de representaciones que brinda sociabilidades y confiere inteligibilidad a los comportamientos humanos.